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这是一个创建于 2729 天前的主题，其中的信息可能已经有所发展或是发生改变。
我想用 python 对一堆数据进行处理，之后供 tensorflow 使用。不知道应该将这堆数据转成什么格式（最好是跨平台的），才能读取速度最快。
这些数据大小约 200G （ matlab 的 mat 格式），是由很多很多的小文件组成的，里面的内容是格式化的数字和字符。
这些数据大小约 200G （ matlab 的 mat 格式），是由很多很多的小文件组成的，里面的内容是格式化的数字和字符。
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chenminghit OP  1
HDF5 怎么样？ google 到了这个。
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aaronzjw 2017-06-30 17:33:55 +08:00 via Android
了解下 hadoop?
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chenminghit OP @aaronzjw hadoop 稍微了解一点，这个学习成本太高了，我应该不需要。
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0ZXYDDu796nVCFxq 2017-06-30 18:56:11 +08:00 via iPhone
二进制应该是最快的，如果设计良好。
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aaronzjw 2017-06-30 18:56:18 +08:00 via Android
@chenminghit 不懂啊，没遇到过这么大的文件读取。 能不能压缩一下
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aaronzjw 2017-06-30 18:56:57 +08:00 via Android
@chenminghit 很多小文件，应该压缩不了多少。。。
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AX5N 2017-06-30 19:14:23 +08:00
重点是数量有多少，得看是瓶颈在 i/o 还是在 python。
如果在 i/o 你就提前合并成一个文件(举个例子，例如 iso 文件)，然后每次读取一定的大小到内存就可以了。 如果数量太大太大的话，python 光是调用函数消耗就特别大，纯 python 我也不知道有什么办法。你可以试试 for 一个千万位的数字，然后再在循环里进行一次乘法操作，慢到你想吐血(1s 左右的时长)。 |
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comzyh 2017-06-30 19:21:47 +08:00 via Android
HDF5 是我见过最好的
其他的可以考虑 pickle, protobuf |
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ruoyu0088 2017-07-01 07:36:39 +08:00
用 h5py 读写 HDF5。
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chenminghit OP @AX5N 文件数量大概是 3000*2000 这么多，每个文件大概 30k 这么大。我需要先用 python 预处理一遍文件，把我需要的内容提取出来，以便 tensorflow 调用。这个过程肯定要删掉很多数据，并且做一些归一化。预处理这个过程需要处理多长时间都无所谓，因为只需处理一遍，可以慢慢处理。主要是 tensorflow 调用那个过程要快
看了楼上各位的回复，我觉得我就去研究一下 HDF5 吧。谢谢各位。 |
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zhmin 2017-07-01 14:48:53 +08:00 via iPhone
hdfs 不适合寸小文件
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chenminghit OP @zhmin 没事，我应该可以将它们拼起来，拼成大文件
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chenminghit OP @zhmin sorry，看成了 hdf5
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hsyu53 2017-07-01 18:27:32 +08:00 via iPad
可以试试 netcdf4，built on hdf5
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chenminghit OP @hsyu53 谢谢。我学习一下
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ecloud 2017-07-02 02:52:22 +08:00
Berkley DB
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fiht 2017-07-02 11:25:37 +08:00
我感觉没有什么问题啊。
就是读取六百万个文件然后处理之后再保存下来然后丢给 TensorFlow 去处理。 你讲处理六百万个文件速度慢一点没关系因为是一次性处理的 那 TensorFlow 那边速度快不快得看机器配置啊 （我没实际用过 TensorFlow 你把六百万个文件挨个读取之后保存成一个 pkl 文件，然后下次要使用的时候直接 load 进来就可以。 搞机器学习的应该很有钱，所以不用考虑内存不足的问题 关注一波楼主，对这个很感兴趣，只是现在没时间没设备，搞不了这个 |
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