请教一个 gradle 版本升级导致 aar 打包出现错误的问题

[royliu]

需要将一个 module 打包成 aar，module libs 目录有第三方提供的 jar 文件，jar 里有一些 xml 配置文件是和 java 文件一个目录编译的。以前用 gradle 版本 2.2.2 进行打包，那些 xml 文件是可以在生成的 xml 文件里找到的。如图：
https://imgur.com/PwwwKH9
这两天将 gradle 版本升级到 3.1.2。发现打包时上面那些 xml 文件以及 assets 目录都没有了。如图：
https://imgur.com/WLwMc0N

项目中第三方库找不到对应的 xml 会报错。网上找了一圈没有什么头绪，希望有大神能指点一下

[airfling]

自己写个 fatJar 的 task，自己打包

task fatjar(type: Jar) {
baseName = project.name + '-all'
from files(sourceSets.main.output.classesDir)
from files(sourceSets.main.output.resourcesDir)
from { configurations.compile.collect { zipTree(it) } } {
exclude "META-INF/*.SF"
exclude "META-INF/*.DSA"
exclude "META-INF/*.RSA"
}
manifest {
attributes 'Main-Class': 'com.test.DemoApplication'
}
}