V2EX = way to explore
V2EX 是一个关于分享和探索的地方
现在注册
已注册用户请  登录
推荐学习书目
Learn Python the Hard Way
Python Sites
PyPI - Python Package Index
http://diveintopython.org/toc/index.html
Pocoo
值得关注的项目
PyPy
Celery
Jinja2
Read the Docs
gevent
pyenv
virtualenv
Stackless Python
Beautiful Soup
结巴中文分词
Green Unicorn
Sentry
Shovel
Pyflakes
pytest
Python 编程
pep8 Checker
Styles
PEP 8
Google Python Style Guide
Code Style from The Hitchhiker's Guide
wuwukai007
V2EX  ›  Python

pandas 在 处理小数据量时(<1000),速度比原生慢好多啊!

  •  
  •   wuwukai007 · 2021-03-30 21:44:57 +08:00 · 2545 次点击
    这是一个创建于 1363 天前的主题,其中的信息可能已经有所发展或是发生改变。
    • 如图
    第 1 条附言  ·  2021-03-31 00:08:46 +08:00
    • 数据量在几千条的时候,像apply,loc 等,就好像有个固定耗时,比原生慢很多
    8 条回复    2021-04-08 16:14:46 +08:00
    chenbojian
        1
    chenbojian  
       2021-03-30 21:47:32 +08:00
    都小数据量了,不需要在意速度了吧
    czfy
        2
    czfy  
       2021-03-30 21:50:11 +08:00 via Android
    毕竟是封装的
    复杂统计模型也不能全部都手写吧
    xiaolinjia
        3
    xiaolinjia  
       2021-03-30 23:50:52 +08:00
    上次我测试的时候,发现
    n1 = np.arange(cnt, dtype=np.int_)
    n2 = list(range(cnt))
    n1 + 2
    [mem + 2 for mem in n2]
    当 cnt 较小的时候,numpy 的广播方式比下面 py 原生循环还慢。之前看文档说,numpy 用的 c 循环,所以比 py 的快。把我整的有点懵。
    liprais
        4
    liprais  
       2021-03-30 23:55:31 +08:00 via iPhone   ❤️ 1
    你这对比的都不是一件事好么
    LeeReamond
        5
    LeeReamond  
       2021-03-31 12:56:09 +08:00
    @xiaolinjia
    https://gist.github.com/GoodManWEN/dc9372c7a0288837aa4ffd4b0ddc85f8

    明显你测试有问题,我测试里长度为 100k 情况下 np 比原生快 200 倍,长度为 1k 下快 55 倍
    xiaolinjia
        6
    xiaolinjia  
       2021-03-31 13:41:58 +08:00
    @LeeReamond 行吧,具体阈值我没测清除,不过 cnt 在 15 以内 py 的列表推导快过 np 广播。
    LeeReamond
        7
    LeeReamond  
       2021-03-31 14:34:02 +08:00
    @xiaolinjia 测了一下确实,我的阈值大概长度 25 左右时速度相等。

    理论上 np 的主要开销在于 ffi,不同的优化程度 ffi 调用开销在几十到几百纳秒不等。C 语言进行这么短的计算的开销可以认为不存在,cache 不会 miss,大概几个 clock 之内搞定,可能个位数纳秒,或者 1 纳秒。

    原生的话,主要在于新建和回收列表的开销,因为这部分已经高度优化了,cache 不 miss 的情况下可能几十纳秒,循环过程的开销也比较高,可能几十纳秒,加在一起得到一个合计的阈值。不过可以看出来 py 追求性能还是颇拉胯的,随着列表长度增长会有明显的开销增长,c 的话可能你长度为 1 和长度为 1000 感受不到什么区别。
    tisswb
        8
    tisswb  
       2021-04-08 16:14:46 +08:00
    目前我用到的 pandas 适合做统计跟可视化等骚操作
    关于   ·   帮助文档   ·   博客   ·   API   ·   FAQ   ·   实用小工具   ·   4542 人在线   最高记录 6679   ·     Select Language
    创意工作者们的社区
    World is powered by solitude
    VERSION: 3.9.8.5 · 75ms · UTC 10:08 · PVG 18:08 · LAX 02:08 · JFK 05:08
    Developed with CodeLauncher
    ♥ Do have faith in what you're doing.